Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 4932702P03Rik-203ENSMUST00000225028 670 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 AC122251.2-201ENSMUST00000227341 603 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
P10404 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Cyp4a10-202ENSMUST00000094886 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm14180-201ENSMUST00000105066 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm15099-201ENSMUST00000179833 573 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
P10404 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms