Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm26723-201ENSMUST00000180771 787 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm43148-201ENSMUST00000198237 520 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Mcpt2-201ENSMUST00000015576 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CtcflA2APF3 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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