Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm14367-201ENSMUST00000119214 1497 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Col5a3Q9JLI2 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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Col5a3Q9JLI2 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm5415-201ENSMUST00000171322 3609 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Col5a3Q9JLI2 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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