Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm6223-201ENSMUST00000178436 871 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm42508-201ENSMUST00000199972 3292 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm19368-201ENSMUST00000221258 4424 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps6-201ENSMUST00000176317 1101 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
OtofQ9ESF1 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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