Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 1810017P11Rik-201ENSMUST00000202592 558 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm9278-201ENSMUST00000205508 553 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm33680-203ENSMUST00000219610 4117 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 AC137871.4-201ENSMUST00000226323 3901 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm15910-201ENSMUST00000127564 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Usp29Q9ES63 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.8 ms