Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Pvrig-ps-201ENSMUST00000199472 204 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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Rnf6Q9DBU5 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Rnf6Q9DBU5 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Rnf6Q9DBU5 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf6Q9DBU5 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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