Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr263-201ENSMUST00000096006 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm27160-201ENSMUST00000184837 199 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms