Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm22492-201ENSMUST00000157192 297 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm5430-201ENSMUST00000182525 915 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm9239-201ENSMUST00000186942 2557 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Casp8ap2-202ENSMUST00000108178 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm5795-202ENSMUST00000166275 612 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm8279-203ENSMUST00000170040 612 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r143-201ENSMUST00000171622 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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Trim12aQ99PQ1 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm4617-201ENSMUST00000178993 331 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Trim12aQ99PQ1 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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