Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm33594-201ENSMUST00000209502 1333 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm23673-201ENSMUST00000157474 298 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Tet2-204ENSMUST00000196398 9021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Herc1-201ENSMUST00000042824 15153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1452-ps1-201ENSMUST00000208396 925 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc71Q8VEG0 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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