Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Cldn17Q8BXA6 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Cldn17Q8BXA6 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Cfap70-203ENSMUST00000056073 3615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cldn17Q8BXA6 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cldn17Q8BXA6 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cldn17Q8BXA6 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cldn17Q8BXA6 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cldn17Q8BXA6 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Cldn17Q8BXA6 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Cldn17Q8BXA6 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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