Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28178-201ENSMUST00000188544 2943 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC155167.2-201ENSMUST00000226127 1945 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 A2ml1-201ENSMUST00000060574 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms