Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Mdm4-ps-201ENSMUST00000121299 6514 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm44712-201ENSMUST00000206250 1076 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm42640-201ENSMUST00000199792 1195 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Atg9aQ68FE2 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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