Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Usp48Q3V0C5 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Usp48Q3V0C5 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Usp48Q3V0C5 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Usp48Q3V0C5 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Usp48Q3V0C5 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Dapp1-203ENSMUST00000136613 2950 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Usp48Q3V0C5 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
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Usp48Q3V0C5 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Usp48Q3V0C5 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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Usp48Q3V0C5 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Usp48Q3V0C5 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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Usp48Q3V0C5 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm37347-201ENSMUST00000193969 3071 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm8126-201ENSMUST00000169587 1764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Usp48Q3V0C5 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms