Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm8865-201ENSMUST00000125697 430 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm16174-201ENSMUST00000137373 402 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm37068-201ENSMUST00000195168 640 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 4930568G15Rik-202ENSMUST00000195635 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm4605-201ENSMUST00000203148 625 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 2210406H18Rik-201ENSMUST00000207806 1108 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC124736.1-201ENSMUST00000226382 419 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC142114.1-201ENSMUST00000227724 328 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Speer4e-201ENSMUST00000159973 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC125328.1-201ENSMUST00000226812 2265 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm28677-202ENSMUST00000186904 615 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm37904-201ENSMUST00000195591 312 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Fxyd4-208ENSMUST00000204950 586 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm39271-201ENSMUST00000212881 434 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm6885-201ENSMUST00000217261 372 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc34Q3UI66 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms