Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm7897-201ENSMUST00000193981 554 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm37925-201ENSMUST00000195352 4255 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Siah1bQ06985 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms