Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NcanP55066 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NcanP55066 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NcanP55066 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC6□□□□□ -1.45
NcanP55066 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NcanP55066 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
NcanP55066 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
NcanP55066 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
NcanP55066 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
NcanP55066 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Vmn1r239-ps-201ENSMUST00000127465 960 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
NcanP55066 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Chek1-201ENSMUST00000034625 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 AC132317.2-201ENSMUST00000227301 519 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
NcanP55066 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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