Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Prkacb-204ENSMUST00000106138 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm36099-201ENSMUST00000221946 1798 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Zmynd11-205ENSMUST00000110636 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Ncor1-204ENSMUST00000101066 8852 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 G630018N14Rik-203ENSMUST00000221171 5888 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm23273-201ENSMUST00000104058 135 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Lum-201ENSMUST00000038160 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
PtprmP28828 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.4 ms