Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Ikzf2-201ENSMUST00000027146 9278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RhoP15409 4930435E12Rik-201ENSMUST00000122078 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm23467-201ENSMUST00000157127 159 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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