Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm22231-201ENSMUST00000101027 73 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm15293-201ENSMUST00000110754 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Grip1os1-202ENSMUST00000135940 1192 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 S100a2-201ENSMUST00000179550 315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm37766-201ENSMUST00000192244 2567 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Vmn2r-ps56-201ENSMUST00000174814 2596 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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