Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm17472-201ENSMUST00000167638 352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 1700015G11Rik-202ENSMUST00000185758 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 1700092E16Rik-201ENSMUST00000214766 753 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 AC113269.1-201ENSMUST00000227185 674 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr1107-201ENSMUST00000099865 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Opn1mwO35599 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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