Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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H2-Q1O19441 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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H2-Q1O19441 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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H2-Q1O19441 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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H2-Q1O19441 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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H2-Q1O19441 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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H2-Q1O19441 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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H2-Q1O19441 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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H2-Q1O19441 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
H2-Q1O19441 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms