Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt14-205ENSMUST00000215093 9274 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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