Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm4032-201ENSMUST00000210886 487 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Desi2-202ENSMUST00000069568 1193 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc47Q9D024 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
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