Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ighv5-21-201ENSMUST00000191935 295 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm18215-201ENSMUST00000204429 798 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC107232.1-201ENSMUST00000227785 1503 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm44539-201ENSMUST00000206010 238 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Atg3Q9CPX6 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms