Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10338-202ENSMUST00000178623 612 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3012-202ENSMUST00000179486 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Agps-203ENSMUST00000175646 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 AC118250.1-201ENSMUST00000228569 875 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1308-201ENSMUST00000099605 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Mapre1-201ENSMUST00000028981 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Rab11fip3Q8CHD8 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms