Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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PcolceQ61398 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PcolceQ61398 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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