Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm14645-201ENSMUST00000118597 417 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm7031-201ENSMUST00000173709 919 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Traf1-209ENSMUST00000201690 386 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm44306-201ENSMUST00000203058 203 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm13649-201ENSMUST00000122325 606 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 4933411O13Rik-203ENSMUST00000146849 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm6871-204ENSMUST00000171059 462 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm29739-201ENSMUST00000191760 529 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms