Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm45473-201ENSMUST00000211452 616 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AL669819.1-201ENSMUST00000225143 330 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm36378-201ENSMUST00000201709 388 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olrf445-ps1-201ENSMUST00000204960 314 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms