Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm27985-201ENSMUST00000185112 378 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 D030045P18Rik-202ENSMUST00000213571 2370 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm36543-201ENSMUST00000217933 542 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 AC160863.2-201ENSMUST00000218392 858 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms