Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm14938-201ENSMUST00000119482 943 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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Sh3bp1P55194 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm17165-201ENSMUST00000096155 493 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
Sh3bp1P55194 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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