Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Defb18-201ENSMUST00000097818 258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Nedd1P33215 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Wfdc15b-202ENSMUST00000109376 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm26037-201ENSMUST00000158150 311 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Wfdc15b-201ENSMUST00000018355 510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Txndc9-203ENSMUST00000192960 472 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Csn2-202ENSMUST00000196163 722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Itih5-201ENSMUST00000026886 7900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Wdr76-201ENSMUST00000028676 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gbp4-201ENSMUST00000100962 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm44956-201ENSMUST00000208277 2887 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Sh2d1b2-202ENSMUST00000162752 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Nedd1P33215 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms