Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm37289-201ENSMUST00000195409 1402 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Hsd11b1-203ENSMUST00000160929 1256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm20707-201ENSMUST00000176201 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Cd200r3-201ENSMUST00000048479 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Cd28P31041 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Cd28P31041 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Cd28P31041 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Cd28P31041 Gm16513-201ENSMUST00000101023 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Cd28P31041 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Cd28P31041 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Cd28P31041 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Cd28P31041 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Cd28P31041 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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