Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm37971-201ENSMUST00000193516 3391 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gabrg2-201ENSMUST00000070725 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Usp17lc-202ENSMUST00000106892 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Dock2-202ENSMUST00000101364 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Amz2-201ENSMUST00000020929 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm29594-201ENSMUST00000191181 398 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Tas2r111-ps2-201ENSMUST00000203794 901 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr829-202ENSMUST00000212229 2590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms