Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
P20040 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
P20040 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P20040 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
P20040 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
P20040 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P20040 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P20040 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P20040 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P20040 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
P20040 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P20040 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
P20040 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm19195-201ENSMUST00000222018 511 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
P20040 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
P20040 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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