Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm29454-201ENSMUST00000190805 393 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm43078-201ENSMUST00000197222 168 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm18618-201ENSMUST00000222211 473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Cdh9-202ENSMUST00000228307 3539 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm45502-201ENSMUST00000209561 252 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Pln-204ENSMUST00000219491 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr419-202ENSMUST00000214725 2685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RhoP15409 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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