Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm5600-202ENSMUST00000211589 2331 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm28114-201ENSMUST00000187232 379 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 1110002O04Rik-201ENSMUST00000194261 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm9315-201ENSMUST00000222696 908 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Zfp560-201ENSMUST00000068079 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm45470-201ENSMUST00000209685 7044 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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PdgfrbP05622 1700014D04Rik-203ENSMUST00000180139 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 AC138765.2-202ENSMUST00000228418 3435 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PdgfrbP05622 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms