Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm15034-201ENSMUST00000120043 349 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm15290-201ENSMUST00000132880 577 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm6472-201ENSMUST00000178147 651 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm5086-201ENSMUST00000210022 1297 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Glod5-201ENSMUST00000033503 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm12267-201ENSMUST00000121609 761 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 4930405L22Rik-201ENSMUST00000198088 585 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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