Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm45908-201ENSMUST00000212977 1177 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 AV026068-220ENSMUST00000224153 1147 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Rps4x-201ENSMUST00000033683 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Tmem209-204ENSMUST00000115160 3485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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AK157302I3ITR1 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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AK157302I3ITR1 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 AC112972.2-201ENSMUST00000228702 2210 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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AK157302I3ITR1 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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AK157302I3ITR1 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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AK157302I3ITR1 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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AK157302I3ITR1 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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AK157302I3ITR1 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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AK157302I3ITR1 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
AK157302I3ITR1 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms