Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm42428-201ENSMUST00000198677 302 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm45343-201ENSMUST00000210452 828 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC153954.2-201ENSMUST00000213811 287 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm24230-201ENSMUST00000104313 129 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Naip6-202ENSMUST00000118574 6827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Atp8a2-201ENSMUST00000080368 12886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms