Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm15779-201ENSMUST00000117470 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Zfp78-204ENSMUST00000207347 3883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm6882-201ENSMUST00000177741 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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