Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Dbi-202ENSMUST00000112648 504 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm23162-201ENSMUST00000175081 121 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm16794-203ENSMUST00000185324 1490 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Dnah2-201ENSMUST00000035539 13569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm11227-201ENSMUST00000119774 471 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm12222-201ENSMUST00000121368 260 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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Usp29Q9ES63 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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Usp29Q9ES63 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Usp29Q9ES63 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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