Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Cts6-201ENSMUST00000021890 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm22210-201ENSMUST00000158101 144 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm17175-201ENSMUST00000172117 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 4930412B13Rik-201ENSMUST00000149239 1276 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Lrif1-203ENSMUST00000106736 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccdc47Q9D024 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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