Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm13270-201ENSMUST00000149137 1686 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm15300-201ENSMUST00000122324 279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r71-202ENSMUST00000226874 5194 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm21655-202ENSMUST00000199295 2975 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm21680-201ENSMUST00000200447 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r123-201ENSMUST00000166948 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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