Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm33843-201ENSMUST00000219313 1637 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Traj7-201ENSMUST00000103733 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Hspe1-ps5-201ENSMUST00000118080 297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm16423-201ENSMUST00000120078 947 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Use1Q9CQ56 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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Use1Q9CQ56 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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Use1Q9CQ56 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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Use1Q9CQ56 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Use1Q9CQ56 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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