Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hpf1Q8CFE2 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hpf1Q8CFE2 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hpf1Q8CFE2 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hpf1Q8CFE2 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hpf1Q8CFE2 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hpf1Q8CFE2 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Hpf1Q8CFE2 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hpf1Q8CFE2 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Hpf1Q8CFE2 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Hpf1Q8CFE2 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Hpf1Q8CFE2 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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Hpf1Q8CFE2 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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Hpf1Q8CFE2 Gm3942-201ENSMUST00000218495 666 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Hpf1Q8CFE2 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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Hpf1Q8CFE2 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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Hpf1Q8CFE2 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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Hpf1Q8CFE2 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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Hpf1Q8CFE2 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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Hpf1Q8CFE2 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Hpf1Q8CFE2 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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