Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28194-201ENSMUST00000187412 484 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28886-202ENSMUST00000187889 484 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 AC160980.2-201ENSMUST00000225131 949 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 AC120347.1-201ENSMUST00000223326 1639 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm38029-201ENSMUST00000192669 2090 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Dtna-206ENSMUST00000221880 4490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Mocs2-217ENSMUST00000184781 1250 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms