Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac7Q8C2B3 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac7Q8C2B3 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hdac7Q8C2B3 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm25152-201ENSMUST00000157117 114 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Sis-202ENSMUST00000167334 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 AC132852.2-201ENSMUST00000216052 2794 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Vmn2r-ps86-201ENSMUST00000174812 871 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Hdac7Q8C2B3 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms