Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm18205-201ENSMUST00000209215 841 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Lmbrd2-204ENSMUST00000227556 8099 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Abcc9-202ENSMUST00000087527 6213 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm38189-201ENSMUST00000194495 1457 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Hmcn2-201ENSMUST00000113532 15646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Trmt2b-201ENSMUST00000087540 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms