Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr688-201ENSMUST00000098155 966 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm19552-201ENSMUST00000194744 2833 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Txlng-202ENSMUST00000112314 3348 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccdc18Q640L5 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Huwe1-201ENSMUST00000026292 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr884-201ENSMUST00000077732 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Olfr318-203ENSMUST00000214728 4552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccdc18Q640L5 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms