Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 4930553J12Rik-201ENSMUST00000023648 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Vmn2r-ps21-201ENSMUST00000177115 2947 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14575-201ENSMUST00000117210 560 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14749-201ENSMUST00000121269 333 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14143-201ENSMUST00000121686 357 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm16554-201ENSMUST00000159471 460 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Lipo1-202ENSMUST00000178735 1188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm28973-201ENSMUST00000189310 613 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 AC122774.1-201ENSMUST00000227703 762 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Zranb1-201ENSMUST00000033265 2210 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Zfp605-201ENSMUST00000086686 2085 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Pcdh15-204ENSMUST00000105426 6802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ccdc34Q3UI66 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms